內(nèi)參抗體可用于評價蛋白質(zhì)免疫印跡法(Western Blot)的效率,比較凝膠中每孔的蛋白上樣量。此類對照可幫助確定樣品間表達水平的差異,以判斷是由細胞裂解物的實際蛋白水平導(dǎo)致,還是由上樣量的差異導(dǎo)致。
內(nèi)參抗體在目標(biāo)蛋白的免疫熒光研究中,也可以作為共染的陽性對照。內(nèi)參抗體分為未標(biāo)記型和標(biāo)記型,標(biāo)記物包括生物素、HRP、FITC、PE、Cy染料和Alexa Fluor染料。
內(nèi)參抗體種類很多,比如β-actin、β-tubunlin、GAPDH、Vinculin、Lamin B、PCNA等,其選擇常使我們困惑。本文將簡單介紹選擇內(nèi)參抗體應(yīng)遵循的五項原則:
一、樣本種屬來源:
首先要考慮實驗樣本來源于什么物種。
1. 哺乳動物的組織或者細胞樣本,通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na,Katpase等。
2. 植物來源實驗樣本,則可以選擇plant actin、Rubisco等。
3. 其他來源樣本研究較少,所以就應(yīng)該參照文獻報導(dǎo),選擇合適的蛋白作為內(nèi)參。
二、分子量大?。?/span>
選擇內(nèi)參抗體時,應(yīng)該考慮目的蛋白分子量的大小,一般保證目的蛋白與內(nèi)參蛋白分子量相差5KD以上。例如,目的蛋白分子量為40KD,此時不適宜選擇β-actin、與GAPDH作為內(nèi)參,可以考慮選擇α-Tubulin或者β-tubulin作為內(nèi)參。三、表達水平:
選擇的內(nèi)參蛋白需要在待測樣本中是高表達的。常用的內(nèi)參蛋白是由管家基因高表達的,是細胞發(fā)育和維持細胞活力所必須的。例如,細胞核的內(nèi)參蛋白 PCNA,在 DNA S 期表達,因此對于非增殖細胞不推薦使用。四、目的蛋白表達定位:
適用范圍 | 名稱 | 貨號 | 分子量 |
胞質(zhì) |
beta I Tubulin | bsm-33041M | 50kDa |
beta Tubulin | bsm-33034M | 50kDa | |
bs-4511R | 50kDa | ||
beta Actin | bsm-33036M | 42kDa | |
bs-0061R | 42kDa | ||
GAPDH | bs-10900R | 36kDa | |
bs-2188R | 36kDa | ||
bsm-0978M | 36kDa | ||
bsm-33033M | 36kDa | ||
alpha Tubunlin |
bs-20496R | 50kDa | |
bs-0159R | 50kDa | ||
Vinculin | bsm-54148R | 117kDa | |
Cyclophilin B | bsm-33228M | 20kDa | |
bsm-52473R | 20kDa | ||
核蛋白 |
Histone H3 | bs-0349R | 15-17kDa |
bsm-33042M | 15-17kDa | ||
Lamin B | bs-23709R | 66-72kDa | |
bsm-33040M | 66-72kDa | ||
PCNA | bs-0754R | 36kDa | |
bsm-52347R | 36kDa | ||
bsm-33035M | 36kDa | ||
TATA binding protein TBP/TBP | bsm-33227M | 38kDa | |
YY1 | bsm-52349R | 46kDa | |
HDAC1 | bs-1414R | 65kDa | |
bsm-52080R | 65kDa | ||
膜蛋白 |
ATPase Na+/ K+ beta 2 (ATPB2) | bs-1152R | 33kDa |
bs-23414R | 33kDa | ||
質(zhì)膜 |
ATP1A1 (Sodium Potassium ATPase) | bs-4255R | 97-110kDa |
bsm-52485R | 97-110kDa | ||
線粒體 |
COX4 | bsm-33037M | 17kDa |
VDAC1 | bs-1461R | 32kDa | |
bsm-52251R | 32kDa | ||
全血/血漿/血清 |
Transferrin | bsm-33243M | 77kDa |
bs-2052R | 77kDa | ||
Albumin | bsm-0945M | 66kDa | |
bs-0945R | 66kDa | ||
細胞增殖標(biāo)志物 |
BrdU | bsm-0917M | 化合物 |
bs-0489R | 化合物 | ||
植物內(nèi)參 | Plant actin | bsm-33128M | 42kDa |
五、表達因素:
選擇蛋白表達不受實驗變量影響的內(nèi)參。
●在做多組織多細胞樣本對比表達量時,最好選用 GAPDH作為內(nèi)參,因為GAPDH是代謝類蛋白,在活組織中表達比較恒定。而β-Actin和β-Tubulin是結(jié)構(gòu)蛋白,不同組織的細胞結(jié)構(gòu)會有差異性;
●而在某些細胞中,由于組織缺氧、糖尿病等因素會導(dǎo)致GAPDH的表達增高,不適合做內(nèi)參;
●涉及細胞增殖的相關(guān)試驗中,c-Jun由于自身表達變化不適合做內(nèi)參;
●凋亡實驗時,TBP、Lamin等也不適合作為內(nèi)參;
●做誘導(dǎo)后樣本或檢測磷酸化等修飾性抗體時,應(yīng)選擇結(jié)構(gòu)蛋白作為內(nèi)參,如β-Actin 和β-Tubulin;
●做各種分泌液樣本的時候,如血漿、乳汁、組織液等,由于沒有完整的細胞結(jié)構(gòu),只能選擇一些分泌蛋白作為內(nèi)參。
內(nèi)參抗體驗證示例